Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HFEQ30201 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HFEQ30201 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HFEQ30201 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms