Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPP1Q1MSJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms