Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DUSP6Q16828 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP6Q16828 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms