Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF239Q16600 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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