Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACKR1Q16570 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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