Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RPE65Q16518 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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