Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDSNQ15517 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms