Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RFTN1Q14699 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RFTN1Q14699 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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