Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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