Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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EBI3Q14213 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EBI3Q14213 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms