Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SPIDRQ14159 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SPIDRQ14159 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SPIDRQ14159 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPIDRQ14159 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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