Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCARB2Q14108 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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