Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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PDE6HQ13956 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6HQ13956 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6HQ13956 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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