Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms