Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP1A4Q13733 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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