Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKD2Q13563 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKD2Q13563 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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