Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TOP3AQ13472 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms