Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PMS2P3Q13401 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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