Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATMQ13315 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATMQ13315 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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