Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RLFQ13129 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RLFQ13129 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RLFQ13129 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RLFQ13129 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLFQ13129 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLFQ13129 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RLFQ13129 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
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