Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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