Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKRN3Q13064 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MKRN3Q13064 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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