Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK3Q13003 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK3Q13003 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms