Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TP53BP1Q12888 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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TP53BP1Q12888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TP53BP1Q12888 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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