Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
STX4Q12846 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
STX4Q12846 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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STX4Q12846 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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