Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC173Q0VFZ6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms