Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLEQ07864 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLEQ07864 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLEQ07864 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms