Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms