Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-1Q07627 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms