Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EGR3Q06889 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EGR3Q06889 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms