Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms