Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC9Q06265 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC9Q06265 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms