Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms