Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC18A2Q05940 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A2Q05940 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms