Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHRNB3Q05901 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB3Q05901 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms