Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms