Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NHLH2Q02577 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLH2Q02577 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms