Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms