Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFITM3Q01628 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFITM3Q01628 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms