Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN7AQ01118 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN7AQ01118 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms