Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSG4Q00888 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms