Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX1P83916 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX1P83916 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBX1P83916 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CBX1P83916 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBX1P83916 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CBX1P83916 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms