Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms