Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IP78347 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms