Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTA1P68133 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms