Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTA2P62736 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms