Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL3P58872 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL3P58872 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms