Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIPPLY3P57055 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms