Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSCP56915 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSCP56915 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSCP56915 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSCP56915 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSCP56915 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSCP56915 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSCP56915 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms