Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NME5P56597 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NME5P56597 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME5P56597 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME5P56597 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NME5P56597 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms